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by 分子デザインはじめました
Today: #177 in Science, Japan on our combined chart.
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Chart positions today · Japan
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Ranking history · Japan
History builds daily. We started tracking this show on the Science, Japan chart recently, so the trend line appears after a second day of data.
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| Date | Combined Rank | Apple Podcasts |
|---|---|---|
| Oct 11 | #177 | #178 |
Latest episodes
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Ep26-3: [Hands-on] Proteina Complexa tutorial
September 20, 2026 · 58 minYoutube https://www.youtube.com/watch?v=b9cXLQNn-To ゲスト: 南慎太朗さん X @shintaro_minami Proteina Complexa についての南さんの Colab Notebook https://colab.research.google.com/github/ShintaroMinami/notebook_proteina_complexa/blob/main…
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Ep 26-2: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale"
August 22, 2026 · 49 minゲスト: 南慎太朗さん X @shintaro_minami (00:00) AIエージェント (05:30) プロジェクト管理とスキル (18:53) Obsidianでのナレッジマネジメント (24:45) オラクル（構造予測モデル）とタンパク質の配列・構造・機能 (40:05) 蛋白質科学会 [01:28] MCP (Model Context Protocol)[18:53] Obsidian[26:39] SolubleMPNN[40:05]…
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Ep 26-1: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) "Design at Scale"
August 8, 2026 · 1 hr 3 minゲスト: 南慎太朗さん X @shintaro_minami Chapter (00:00) 駒場でのセミナー (04:21) OpenDDE, WRAPS, Protenix (19:26) Cloud computing, RunPod (31:02) Start-up でのデザイン (35:10) BoltzGen, Codex (42:02) Design Start-up 働き方 (54:12) EOR, Remote work [0:01]…
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Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips
July 13, 2026 · 2 hr 2 minChapter (0:00:00) 祝ポッドキャスト２周年！ (0:01:50) 浜田さん論文１（DNAハイドロゲル） (0:16:00) Wet Lab Tips 1（キャピラリー粘度測定・Echo分注機） (0:20:17) 浜田さん論文２（動的DNAネットワーク） (0:32:10) DiffusionモデルでDNAオリガミ論文 (0:40:37) Wet Lab Tips 2（ピペット、培養、クローニング） (1:00:03)…
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Ep 24: [Journal] Membrane Protein Designs
April 24, 2026 · 2 hr 30 minEp 24: Membrane Protein Design Journal Club Ep 20-1 ラボミーティングでたこ焼き作る話https://open.spotify.com/episode/7jpHi8W1eNAoMtQz9GwY44 紹介した論文 [0:16:36–] 新津 Deep learning-based joint sequence–structure de novo membrane protein design Rudden et al…
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Ep 23: [Interview] Naohiro Terasaka (Science Tokyo) “Just Evolve it!”
April 3, 2026 · 2 hr 54 min・寺坂尚紘先生 https://nterasaka.wixsite.com/terasaka-lab https://x.com/NaohiroTerasaka ・Science Tokyo ELSI ・MULTI-evolve ・Ref: EVOLVEpro ・PLACER https://github.com/baker-laboratory/PLACER https://www.pnas.org/doi/10.1073/p…
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Ep 22: [Interview] Takashi Kanamori (GeneFrontier. Corp.) “The Making of PURE”
February 1, 2026 · 1 hr 45 minゲスト：金森崇さん ジーンフロンティア株式会社基盤技術開発部 部長ジーンフロンティア https://www.genefrontier.com/ PURE frex https://www.genefrontier.com/solutions/purefrex/ PURE system の論文 Cell-free translation reconstituted with purified components. Y. Shimizu et al., Nat…
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Ep 21: Building momentum
December 31, 2025 · 37 min生体分子設計研究会 2025/12/10 BindCraft 論文GitHubGoogle ColabBoltzGen プレプリントGitHub 南慎太郎さん https://x.com/shintaro_minami森脇さん https://x.com/Ag_smith GeneScript人工遺伝子合成 IDT eBlock, gBlock Foldseek (構造ベースのクラスタリングに便利): Mmseq2 (配列ベースのクラスタリングに便利): 松林研…
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Ep 20-1: [Journal] BoltzGen, ProteinHunter, CATNIP, De novo metathase, RF2-PPI
December 23, 2025 · 1 hr 18 min岡本紹介論文一本目 Connecting chemical and protein sequence space to predict biocatalytic reactions https://doi.org/10.1038/s41586-025-09519-5 岡本紹介論文二本目 De novo design and evolution of an artificial metathase for cytoplasmic olefin…
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Ep 20-2: [Journal] BoltzGen, ProteinHunter, CATNIP, De novo metathase, RF2-PPI
December 23, 2025 · 1 hr 3 min岡本紹介論文一本目 Connecting chemical and protein sequence space to predict biocatalytic reactions https://doi.org/10.1038/s41586-025-09519-5 岡本紹介論文二本目 De novo design and evolution of an artificial metathase for cytoplasmic olefin…
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Ep 19: [Interview] Shunsuke Tagami (RIKEN) “Connecting the dots”
November 15, 2025 · 2 hr 11 min理化学研究所 生命医科学研究センター 高機能生体分子開発チーム Design of facilitated dissociation enables timing of cytokine signalling Dr. Adam Broerman Dr. Florian Praetorius エフェクター結合でターゲットを解離させる (koffを上げる)メカニズムはkick outで正しい。エフェクターがinduced-fitすることで…
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Ep 18: [Interview] Arisa Uchida (Univ. Tokyo) "Fortune favors the bold."
October 11, 2025 · 1 hr 43 minIPD Summer Research Program Association for Asian Studies 経済学とコンピュータサイエンス The University of Tokyo, PEAK Dr. Sebastian Ols トロント大学交換留学プログラム バイオメディカルエンジニアリング専攻 構造生物学ラボ→Ikura lab, Princess Margaret Cancer Centre ライス大学プログラム 女性STEM学生向け1ヶ月プログラム…
About the show
このpodcastは、さまざまな形で分子デザインに携わるメンバーが分子デザインについてゆるく語りつつ情報発信する番組です。タンパク質デザインや核酸 (DNA/RNA)デザインが主なトピックです。X: https://twitter.com/Biomol_Design